武雅蓉，天津大学生命科学学院英才副教授，特聘研究员，长期从事病原微生物基因组进化与溯源研究。围绕 “病原微生物从哪里来、如何变、往哪去” 这一核心问题，构建并完善了“多类型变异鉴定—群体遗传分析—适应性进化推断”三位一体的研究体系，并得到成功实践应用，从进化动力学理论探索到基因组流行病学实际应用，形成了较为完整的研究闭环。

相关成果以第一作者或通讯作者（含共同）发表于 Nature Genetics、Nature Communications、The Lancet Microbe、PNAS 等国际高水平学术期刊。近五年主持或承担国家自然科学基金青年科学基金项目（C类）等科研课题5项，并参与多项国家级与省部级项目。参编英文专著2部，获授权发明专利1项、软件著作权2项，担任 Nature Communications、Communications Biology 等期刊审稿人。

日常工作中，既和“看不见的微生物”打交道，也和“看得见的数据”较真；围绕大规模基因组数据，借助生物信息学工具开展系统分析与挖掘，并在进化理论指导下进行多层次验证与解析；既关注宏观演化规律，也乐于在细微变异中“较劲”。课题组氛围轻松但不松散，鼓励思考、欢迎提问，也尊重每一个“看起来有点不一样”的想法。

诚邀具有生物信息学、生物学/微生物学、公共卫生与预防医学、计算机、数学等背景的研究生与本科生加入。

课题组目前正处于起步与拓展阶段，你不仅是参与者，也可以成为建设者之一（也意味着，你的每一份努力，都可能成为课题组“从0到1”的一部分）。如果你对病原微生物的“前世今生”充满好奇，愿意在数据与算法中寻找答案，这里或许会是一个不错的起点。

欢迎志同道合的同学加入，一起把有意思的问题做成有价值的研究成果——也顺便完成一次属于自己的“进化”。

Researcher ID: https://www.researchgate.net/profile/Yarong-Wu

ORCID: http://orcid.org/0000-0003-4900-315X

在病原微生物进化动力学与基因组流行病学领域的代表性成果包括： 

1. 细菌泛基因组结构变异分析与创新理论

相比SNP等单点变异，基因组重排涉及片段更长、结构更复杂，长期因解析困难而缺乏系统研究。该研究在群体基因组层面系统解析了鼠疫菌基因组重排的发生模式与进化驱动机制，建立了适用于高频重排微生物的研究框架与技术路径，为分子监测和疫情溯源提供了重要基础。研究表明细菌重排受到显著的梯级正向选择压力，深化了对泛基因组层面进化规律的认识。同时，系统鉴定的重排热点及其关联操纵子，为毒力机制解析、疫苗设计及基于结构变异的分子检测技术开发提供了潜在靶点（Nature Genetics, 2025）。

2. 细菌核心基因组分析理论和技术突破

变异是驱动微生物进化的核心动力，尽管其在基因组上随机产生，但往往在特定“热区”集中分布并影响致病性、传播和耐药等关键表型。通过整合全球3000余株鼠疫菌基因组数据，系统鉴定出45个变异热区，发现具有相似种群分布模式的热区在蛋白互作网络中亦呈紧密关联，提示其可能存在上位相互作用。在排除序列组成和同源重组等因素后，结果表明正向选择并非唯一驱动力，基因组区域间变异速率差异同样发挥重要作用，可能体现为一种“进化风险管理策略”。该研究揭示了细菌基因组变异热区的分布规律及其潜在形成机制，深化了对变异产生与选择固定过程的理解（Nature Communications, 2025），并被 Nature Reviews Microbiology 的 Genome Watch 专栏作为该领域的重要进展加以介绍。

3. 基因组流行病学方法在病原溯源与公共卫生中的应用

       综合历史学、考古学、基因组进化、生态学等多学科资料，系统解析了第二次鼠疫大流行的传播来源，表明其在西欧的持续流行与来自中亚或东欧的多次传入密切相关（PNAS, 2021）。相关成果获得PNAS杂志同期正面评述，称该工作是对鼠疫历史流行认识的“范式改变”，并被 Science、Nature Reviews Microbiology、Trends in Microbiology 等权威期刊引用。在此基础上，进一步面向国家公共卫生与生物安全需求，拓展形成面向现实疫情监测与溯源的技术体系，为肺炎支原体暴发、鼠疫区域流行及耐药肺炎克雷伯菌传播等研究提供关键支撑。相关成果以第一或通讯作者发表于 The Lancet Microbe（2025）、Emerging Infectious Diseases（2024）、Emerging Microbes & Infections（2022）及 Communications Biology（2023，2025）等期刊。